Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms