Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC5Q9UQL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC5Q9UQL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms