Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM33Q9UPN9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms