Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZMYND8Q9ULU4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms