Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTBP2Q9UKA9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP2Q9UKA9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms