Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR3Q9UJK0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR3Q9UJK0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms