Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEFF2Q9UIK5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms