Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms