Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms