Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD2Q9UBJ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms