Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGAP28Q9P2N2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms