Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL42Q9P2K6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms