Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDE1Q9NXR1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms