Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWQ4

GPATCH2L, G patch domain-containing protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH2LQ9NWQ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPATCH2LQ9NWQ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPATCH2LQ9NWQ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPATCH2LQ9NWQ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms