Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP5S1Q9NUS5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP5S1Q9NUS5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms