Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXD4L1Q9NU39 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD4L1Q9NU39 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms