Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM138Q9NPI0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM138Q9NPI0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM138Q9NPI0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms