Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDH12Q9NPG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms