Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHS2Q9NP85 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPHS2Q9NP85 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms