Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC4Q9NNZ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC4Q9NNZ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms