Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN1Q9HCN4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN1Q9HCN4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPN1Q9HCN4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN1Q9HCN4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms