Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP29Q9HBJ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP29Q9HBJ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms