Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAE3

EFCAB1, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB1Q9HAE3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB1Q9HAE3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms