Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
BRIP1Q9BX63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BRIP1Q9BX63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms