Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP2Q9BSJ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP2Q9BSJ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms