Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTP3Q9BQQ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms