Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM4BQ9BQ04 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms