Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL4Q9BPW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOL4Q9BPW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms