Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN18Q99952 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN18Q99952 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN18Q99952 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN18Q99952 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN18Q99952 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN18Q99952 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms