Protein–RNA interactions for Protein: Q99729

HNRNPAB, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPABQ99729 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms