Protein–RNA interactions for Protein: Q99729

HNRNPAB, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPABQ99729 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HNRNPABQ99729 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HNRNPABQ99729 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPABQ99729 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPABQ99729 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms