Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC38A2Q96QD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms