Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK15Q96Q40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK15Q96Q40 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms