Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB3A2Q96PL1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB3A2Q96PL1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCGB3A2Q96PL1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCGB3A2Q96PL1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCGB3A2Q96PL1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms