Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00615Q96LM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00615Q96LM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms