Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PHACTR3Q96KR7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PHACTR3Q96KR7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PHACTR3Q96KR7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PHACTR3Q96KR7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PHACTR3Q96KR7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms