Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms