Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJA3Q96EY1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA3Q96EY1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms