Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP4Q96DX8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP4Q96DX8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms