Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN23Q96B33 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN23Q96B33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms