Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS33AQ96AX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms