Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VOPP1Q96AW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VOPP1Q96AW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms