Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT1Q8NF37 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LPCAT1Q8NF37 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms