Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAAF3Q8N9W5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms