Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD42Q8N9B4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD42Q8N9B4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD42Q8N9B4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms