Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSGALNACT2Q8N6G5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms