Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf40Q8IXQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf40Q8IXQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms