Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VSTM4Q8IW00 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM4Q8IW00 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
VSTM4Q8IW00 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms