Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A9Q8IVB4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms