Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRLF3Q8IUI8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLF3Q8IUI8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms