Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG3Q86VR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RETREG3Q86VR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms